由于蒙哥的死亡,蒙古帝国的最高阶层突然停止了行动。蒙哥在西南的战役突然结束。他的军队保有了已经占领的领土,但是没有增加新的领土。他们也没有打算与其他征宋的蒙古军队会合。蒙哥的尸体被运回到蒙古东北部,葬在他父亲拖雷和他的祖父成吉思汗的墓旁。蒙古人又用了二十年时间才最终打败了宋朝。
汗位继承的无序性再次造成蒙古帝国的混乱和分裂。由于没有具体规定由成吉思汗后代的哪个系继承汗位,因此必须召开忽里台选举新汗。上文我们已经介绍了围绕选举蒙哥所发生的种种斗争、选举的争议以及继位后的政治清洗,等等。这一切使得后来的选举愈加困难,并且玷污了忽里台的形象。显然,军事实力最强的领袖可以左右选举(比如,拔都在蒙哥称汗一事上所起的作用)。对汗位最强有力的挑战全凭军事实力,而不是什么特定的继承原则。如果两位领先的候选人觉得他们实力相当,相互间发生冲突的危险便会大增。这样的分裂肯定不利于蒙古帝国内部的安定。蒙哥1251年的即位造成了四个蒙古王族中的两个,即窝阔台和察合台后裔的离心离德。他们肯定在寻找机会夺回大汗宝座,而蒙哥的死正好提供了这样一种可能。